События Fate/Apocrypha происходят в мире параллельном миру Fate/stay night, в котором Грааль был убран из города Фуюки после Третьей Войны. История начинается с того, что в Румынии был обнаружен «726-ой Святой Грааль». Его похитила и привезла в Румынию семья Иггдмилленния. Это знаменует начало Великой Войны Святого Грааля в городе Трифас с двумя противоборствующими сторонами: Чёрная Фракция, члены которой являются частью семьи Иггдмилленния и Красная Фракция, члены которой были посланы Ассоциацией Магов, за исключением одного участника от Церкви. Грааль также призывает Рулера выступать в качестве посредника в Войне Святого Грааля.

Участниками Пятой войны за Святой Грааль были дети, и тем не менее противостояние мастеров было жестоким и кровопролитным. Но какие же ужасы явятся миру, если за дело примутся взрослые, опытные волшебники, принимающие холодные решения даже в отношении собственных родственников и любимых? Четвертая война разобьет много сердец и разрушит множество жизней. На поле боя сойдутся очень разные люди - от учащегося в Ассоциации до городского маньяка. Но кому же из них будет суждено добраться до Грааля и исполнить свою мечту?

Вот уже много лет продолжается война за Святой Грааль - священный артефакт, способный исполнять желания. Маги и их слуги, души великих героев из прошлого, сражаются до тех пор, пока не останется только один, единственно достойный Святой Чаши. Ареной боев был избран маленький японский городок - и в результате прошлой войны он сгорел почти дотла. И вот Эмия Широ, слабейший из избранных Граалем в новой войне чародеев, чьи родители погибли в том пожаре, случайно вызывает сильнейшего слугу... Исполненный желания не допустить подобного впредь, он вступает в бой, где его противники - бессмертные души и могущественные маги, где он может полагаться лишь на свою веру и могущество своего слуги...

Когда я был маленьким, в своих сновидениях я попадал в иное пространство, так называемый «мир вечности». Во сне я превращался во взрослого человека, одетого в причудливые одежду и маску. Теперь пришло время бросать кость. Игра «Мир вечности» , начавшаяся с броска костей , была судьбой? Жизнью? Или, может быть, самим миром? Я с удовольствием проводил время, играя в кругу незнакомых мне личностей. Пока однажды я сам не стал фигурой на игровом поле.

В 2019 году мир переменился: возникли такие явления как врата, монстры, система и игроки, которых ранее не существовало. На протяжении 5 лет человечество и захватчики боролись за власть и территории. Наконец, последний босс «Снежная королева» явилась. Если убить её, человечество сможет обрести свободу и вернуться к прежней жизни. 24 ноября 2024 года четверо из 5 игроков вошли в последнее подземелье в Антарктиде, чтобы победить финального босса на территории Земли. Одним взмахом руки «Снежная королева» заморозила Тихий океан, повергнув человечество в отчаяние. Последнему игроку удалось победить босса, однако в процессе поглощения её ядра он превратился в ледяную глыбу. А спустя 25 лет, когда поглощение…

В конце света Е Чжунмин боролся за выживание, и в тот момент, когда его жизнь остановилась, он возродился! Знакомый золотой линкор, знакомое лотерейное колесо и знакомая осада зомби… Это дар или наказание? Мы пока не знаем, но Е Чжунмин намерен жить! С его десятилетним опытом выживания в постапокалиптических условиях, он полон решимости выжить! Он найдет ответ на вопрос о колесе судного дня и оправдает своё имя!

Адаптация Ю-Ги-О! Арк Файв в виде манги Сюжет манги полностью отличается от аниме