"Евангелион" - это история о борьбе человечества с таинственными "Ангелами" - гигантскими инопланетными машинами (или, возможно живыми организмами). Их намерения неочевидны, но их действия могут привести к гибели тысяч людей. И сражаются с ними не военные, а лишь немногие подростки, способные управлять гигантскими боевыми машинами - Евангелионами, единственным оружием, способным противостоять "Ангелам". Однако битва за Землю - лишь фон, а главное сражение развернется в глубине душ юных пилотов...

Бывшая девушка Итимацу Кайро, Кусакабэ Хиёри, исчезнувшая 7 лет назад, однажды снова появляется перед ним. Как человек, который был обращён в преданного последователя религии Хиёри, он стал неспособен жить в реальности, когда она ушла. Воссоединившись, она выскрывает ему своё необоснованное требование: «Итимацу-кун, я хочу, чтобы мои роды были записаны, поэтому дай мне свою сперму».

К Земле приближается гигантский астероид. И имя ему - Пи... Простой парень, такой же, как и мы с вами, попадает на Луну и становится свидетелем катастрофы. Как он поведёт себя? Что ждёт его впереди? Как до такого вообще дошло???!!!

Юки Татибана, замкнутый первоклассник, убеждён, что на четвёртом этаже его школы находится пристанище сверхъестественных существ, которых видят лишь несколько детей (и ни один взрослый). Он беспокоится о недавнем появлении других существ, уже не столь дружелюбных; и насчёт своей способности с возрастом видеть истинную суть вещей. Большинство учащихся издеваются над Юки - из-за его странных заявлений и поступков его считают сумасшедшим. Единственные люди, с кем он общается, это добрый и непредубеждённый школьный сторож, переведённый ученик Макото Сузуки, сидящий за партой напротив, и таинственный парень IQ, постоянно носящий коробку на голове.

Два человека, две любви, две судьбы. Бессилие, тоска и обреченность. Вот основа и посыл данной манги. Эта история – чистейший ангст, наполненный глубокой душевной болью героев, с целью дать почувствовать и проникнуться этой болью читателям. С одной стороны, мы видим повседневность и людей, мечтающих о будущем, осознающих, но не желающих принимать тот факт, что их жизни обречены. С другой стороны, мы видим ужасы разрушения – разрушения мира и человеческих судеб. То, что совершенным оружием стала простоя японская школьница – это и дань времени, в котором была создана работа (это была целая эпоха, когда простые японские школьники решали судьбу мира и вселенной, будучи уникальными юзерами некой вундервафли)…